Home Notizia Mondo Perché Omicron è ancora il più grande “salto evolutivo” di SARS-CoV-2

Perché Omicron è ancora il più grande “salto evolutivo” di SARS-CoV-2

0
134

scienziati in un laboratorio che indossano maschere che sequenziano un genoma usando una pipetta
I ricercatori aiutano a far luce sul motivo per cui la variante Omicron di SARS-CoV-2 può eludere l’immunità, in una certa misura. T. Narayan/Bloomberg tramite Getty Images
  • Omicron è attualmente il variante dominante di SARS-CoV-2 a livello globale.
  • È in grado di eludere la precedente immunità da infezione e vaccinazione, che ha attivato ampi programmi di vaccinazione di richiamo in molti paesi.
  • La sua capacità di eludere l’immunità è dovuta alle mutazioni che si verificano sulla sua proteina spike, che interrompe il legame dell’anticorpo.

Fin dallo sviluppo dei vaccini per SARS-CoV-2, il virus che causa il COVID-19, c’è stata la preoccupazione che il virus potesse mutare in un modo tale da eludere l’immunità.

Naturalmente, con la scoperta del variante Omicron alla fine di novembre 2021, alcune di queste paure sono diventate realtà. Sebbene ci siano prove che tre dosi di vaccini mRNA possono fornire immunità, la sua maggiore capacità di eludere l’immunità dalla vaccinazione e da infezioni precedenti rispetto ad altre varianti ha sorpreso molti ricercatori.

La scoperta che potrebbe eludere l’immunità ha portato a una corsa per sequenziare il genoma della variante per individuare esattamente come potrebbe farlo.

Un team di ricercatori dell’Università del Missouri, Columbia e dell’Università del Nebraska è stato in grado di sequenziare Omicron. Hanno recentemente pubblicato i loro risultati nel Giornale di autoimmunità.

“Sappiamo che i virus si evolvono nel tempo e acquisiscono mutazioni, quindi quando abbiamo sentito parlare per la prima volta della nuova variante di Omicron, abbiamo voluto identificare le mutazioni specifiche di questa variante”, ha affermato il coautore Dr. Kamlendra Singh, vicedirettore dell’Università del Missouri Nucleo di interazioni molecolari.

Sequenziamento Omicron

Utilizzando le sequenze del genoma di Omicron rese disponibili entro il 26 novembre 2021, il team le ha elaborate per identificare le mutazioni. Hanno selezionato le mutazioni che si sono verificate su oltre il 50% delle sequenze analizzate e hanno trovato 46 mutazioni ad alta prevalenza uniche per la variante Omicron.

Di questi, 23 sono stati localizzati nella proteina spike, che i ricercatori hanno identificato come cruciale per l’infettività di SARS-CoV-2, e i vaccini mRNA sono stati progettati per creare anticorpi che la colpiscano.

Utilizzando i modelli esistenti della proteina spike, hanno modellato la sua interazione con gli anticorpi per studiare come le mutazioni potrebbero aiutare Omicron a eludere l’immunità.

Questi hanno mostrato che il posizionamento delle mutazioni interferiva con il legame e le interazioni con gli anticorpi. “Molte mutazioni si trovano nei punti del dominio di legame del recettore della proteina spike, dove si suppone che gli anticorpi si leghino”, ha detto il dottor Singh MNT in un’intervista.

“Se c’è una mutazione, ovviamente, si potrebbe pensare che gli anticorpi non saranno effettivamente legati alla proteina spike e che questo può ridurre l’efficacia della vaccinazione e dell’infezione precedente”.

Interessati a determinare in primo luogo come si era evoluta la variante Omicron, i ricercatori hanno utilizzato l’analisi filogenetica per mappare le sequenze di ciascuna delle varianti Alpha, Beta, Gamma, Delta, Mu e Omicron.

Il documento conclude che Omicron è più strettamente correlato alla variante Gamma di SARS-CoV-2.

Il più grande “salto evolutivo” di SARS-CoV-2 mai realizzato

Spyros Lytras, un virologo evolutivo e dottorando dell’Università di Glasgow, che non è stato coinvolto nella ricerca, ha descritto Omicron come il più grande “salto evolutivo” di SARS-CoV-2 che abbiamo visto finora. Ha anche spiegato che non è un “sotto-clade” di alcuna variante di preoccupazione precedentemente nota.

Ha spiegato i risultati del Giornale di autoimmunità carta in una e-mail a MNT: Il documento “non afferma che Omicron si sia evoluto dal Gamma clade”, ha detto Lytras.

“Quello che dicono è che il clade Omicron condivideva un antenato comune più recente con il clade Gamma rispetto a tutti gli altri [variants of concern] cladi. L’ultimo antenato comune di Omicron/Gamma non era né Omicron né Gamma all’epoca. Questa non è una novità, dal momento che il posizionamento del clade Omicron nell’albero può essere visualizzato all’indirizzo [Nextstrain], che è uno dei migliori strumenti disponibili per esplorare l’albero SARS-CoV-2”.

Ha rivelato i risultati della sua stessa ricerca, attualmente in fase di pre-stampa, che suggeriscono che le mutazioni che i ricercatori hanno trovato in Omicron sembrano essere benefiche per il virus solo quando sono tutte presenti insieme.

La ricerca di Lytras ha mostrato: “Omicron ha accumulato in modo indipendente alcune mutazioni di evasione immunitaria che abbiamo visto prima, ma la maggior parte dei suoi cambiamenti unici non sono previsti per eludere l’immunità da soli”, ha detto il ricercatore.

“Tuttavia, il picco di Omicron ha molti cambiamenti che non sono mai stati visti prima nella circolazione del SARS-CoV-2 o dei virus dei pipistrelli più strettamente correlati al SARS-CoV-2, come mostriamo nella nostra prestampa”.

“Gli effetti dell’evasione immunitaria previsti […] vengono misurati individualmente, quindi le mutazioni che, da sole, hanno un piccolo effetto antigenico, potrebbero aumentare in modo additivo l’effetto quando sono presenti insieme (come in Omicron)”, ha spiegato Lytras.

“La spiegazione più probabile di tutti questi cambiamenti imprevisti che si manifestano in una singola variante è ‘epistasi positiva’, cioè questi cambiamenti sono benefici per il virus e lo fanno eludere l’immunità o trasmettere più velocemente, solo quando sono tutti presenti contemporaneamente .”

“Complessivamente, [Omicron] ha accumulato un gran numero di mutazioni che sembrano essere benefiche per il virus solo quando sono presenti insieme, e anche se la maggior parte dei cambiamenti non sembra aumentare fortemente l’evasione immunitaria da soli, quando sono presenti insieme, sicuramente consentono al virus di eludere precedentemente acquisito immunità – ovviamente in una certa misura – come è chiaro dall’onda Omicron che il mondo sta affrontando in questo momento”.

– Spyros Lytras

Per aggiornamenti in tempo reale sugli ultimi sviluppi riguardanti il ​​nuovo coronavirus e COVID-19, fare clic su qui.